微生物存在于世界的各个角落。近年来，随着测序技术的发展，对于微生物组学的研究持续火热。与此同时，对技能的要求也是越来越高，尤其是数据库建立、编程语言开发、绘图工具使用技巧及算法模型选择，成为广大科研工作者面临的具体问题。
本次生信培训班分为四个阶段
1、掌握必备的基础知识
如微生物组研究现状与应用、分析流程、方案设计以及Linux的常用操作和软件安装等。
2、掌握16S以及宏基因组数据分析结果及应用
深度剖析16S与宏基因组建库测序原理及分析结果解读，深度诠释各个分析结果。
3、手把手带你进行微生物组学数据的分析
包括微生物多样性测序数据处理和宏基因组数据分析，如原始数据的质控和拼接、OTU聚类、物种注释、宏基因组数据的组装、基因预测以及基于物种丰度、功能丰度表进行的有效信息的统计分析。
4、深度体验微生物组大数据挖掘的奥秘
基于丰富的项目分析经验，针对不同研究目的，提供专业性分析方案及数据深度挖掘思路，并通过不同软件进行结果可视化。
主办单位：北京市计算中心有限公司
协办单位：
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
举 办 地：北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排：2025年6月25-27日（周三-周五） 上9:30-11:30 下13:30-17:00
日期 | 主题 | 内容 | 备注 |
第一天 | 微生物组学研究现状及应用 | 1、微生物组学研究现状及应用 2、微生物组实验设计及测序原理 3、生物信息学背景知识分享 | 理论 |
微生物组学数据分析上机基础 | 1、Linux常用命令使用和上机操作 2、Linux环境下软件安装 | 理论+ 上机操作 | |
微生物多样性数据分析 | 1、质控流程：双端序列合并、提取barcode、质控、样品拆分、切除引物 2、生成OTU：序列格式转换、去冗余、聚类生成OTU 3、OTU筛选：嵌合体生成原理及去除方法、筛选细菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表 4、物种注释及进化树构建 5、常用Alpha多样性指数计算 6、常用Beta多样性距离矩阵计算 7、统计分析 7.1、箱线图展示Alpha多样性及组间比较统计 7.2、散点图展示样品及组间主坐轴分析(PCA/PCoA/NMDS) 7.3、样品与组间相关分析，并用热图可视化结果 | 演示+ 上机操作 | |
第二天 | 宏基因组数据分析与结果解读 | 1、宏基因组分析基本策略 2、数据质量评估 3、数据质量过滤 4、宿主污染过滤 5、数据组装 | 理论 |
1、基因预测 2、物种注释（MEGAN、Krona） 3、功能注释（KEGG、eggNOG） 4、统计分析 4.1、样本聚类分析（物种、功能、基因） 4.2、差异分析（物种、功能、基因） | 演示+ 上机操作 | ||
第三天 | R语言基础 | 1、R语言概述及软件安装 2、拓展包package的安装和帮助系统使用讲解 3、数据表格的导入导出 4、常用的数据结构（重点介绍向量、数据框）的操作方法 5、编程中常用的控制语句（if判断、for循环） 6、R语言中常用函数的使用及编写 7、plot基础绘图 | 演示+ 上机操作 |
数据挖掘与可视化实现 | 1、R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用 韦恩图、花瓣图、散点图、热图、盒形图（箱线图）等 | 演示+ 上机操作 | |
1、网络分析（Igraph等） 2、差异物种分析LEfSe分析 3、KEGG和COG预测分析 4、进化分析ITOL 5、微生物溯源分析 6、微生物状态转移分析 | 演示+ 上机操作 |
注：内容以实际发生为准；若调，会提前通知。
【报名费用】
注册费：4200元/人（含当期听课费、资料费、证书费、考试费（如有））。
提供当期视频回放以供复习使用。
开具增值税发票，提供盖章通知、结业证书等相关材料。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元；
2、4+1团报，可免费赠送一个名额；
3、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种；
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
【咨询请联系】
张老师： 18618295767（微信同号）
郭老师： 18976866894
QQ 号： 3498448850
邮 箱： bcc_peixun@163.com
【注】开课前一周会发送邮件通知；若未接到邮件通知，请电话咨询。
