
在生物医药迈向AI 2.0时代的今天,如何利用计算工具精准设计高亲和力的抗体已成为行业核心竞争力。本课程旨在带你跨越从“蛋白结构基础”到“AI生成式设计”的知识鸿沟。我们将深度解析抗原-抗体界面的识别机制,重点攻克决定抗体特异性的CDR-H3环路设计,并掌握SAbDab、IMGT等核心行业数据库的使用精髓。通过理论与实操的紧密结合,你将建立起一套完整的结构生物学视角,为后续的药物研发打下坚实的学术基石。
本课程更是一场从结构到序列的“实战演习”,完整覆盖了当前最尖端的AI设计管线。你将亲自上手操作RFdiffusion扩散模型,实现基于特定表位约束的Binder骨架生成;随后利用ProteinMPNN算法进行高通量序列设计,并完成复合物结构的预测与验证 。无论你是希望提升设计效率的研发人员,还是向AI生物学转型的探索者,这都将是你抢占生物计算高地的绝佳机会。
主办单位:北京市计算中心有限公司
协办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
课程安排:2026年4月17-19日(周五--周日)上9:30-11:30 下13:30-17:00
第一天:蛋白结构与抗体设计基础 | |||
节次 | 课程主题 | 主要内容 | 课程类型 |
第1节 | 蛋白与结构生物学基础 | 蛋白一级/二级/三级/四级结构 α螺旋、β折叠 氨基酸理化性质 蛋白折叠与稳定性 | 理论 |
第2节 | PDB文件与三维结构表示 | PDB文件结构: ATOM/HETATM Chain ID Residue编号 坐标体系 实验结构与AlphaFold结构 | 理论 |
第3节 | 蛋白与抗体数据库 | UniProt、PDB、AlphaFold DB、SAbDab、IMGT:数据类型、编号体系与使用场景 | 理论 |
第4节 | 蛋白结构可视化基础上机 | 使用PyMOL打开抗原结构 识别链与残基 显示二级结构 从PDB提取FASTA | 上机 |
第二天:抗体结构、表位识别与扩散模型设计 | |||
节次 | 课程主题 | 主要内容 | 课程类型 |
第5节 | 抗体结构与CDR基础 | 抗体结构组成 VH/VL Fab与scFv CDR1/2/3 CDR-H3的决定性作用 | 理论 |
第6节 | 抗原-抗体界面与表位识别上机 | 在PyMOL中分析抗原-抗体复合物 标记表位残基 导出表位列表 | 上机 |
第7节 | 基于扩散模型的binder设计原理 | 生成式结构设计思想 RFdiffusion的输入/输出 表位约束设计逻辑 | 理论 |
第8节 | RFdiffusion上机实践 | 从抗原结构与表位出发运行RFdiffusion 生成binder结构 理解输出文件 | 上机 |
第三天:序列设计与scFv转化 | |||
节次 | 课程主题 | 主要内容 | 课程类型 |
第9节 | 结构到序列:ProteinMPNN原理 | 结构约束下的序列设计思想 ProteinMPNN输入/输出 采样温度与多样性 | 理论 |
第10节 | ProteinMPNN上机实践 | 对RFdiffusion生成的binder运行Protein-MPNN 获得多条候选序列 | 上机 |
第11节 | 结构与复合物验证上机 | 单体结构验证 复合物结构预测 表位覆盖率与界面合理性评估 | 上机 |
第12节 | 完整抗体设计流程综合实训 | 抗原→表位→binder→序列→验证 讨论binder向scFv graft的工程思路 | 上机 |
【主讲老师】
主讲老师具有多年生物信息学领域研究经验;研究方向:蛋白结构分析、AIDD、机器学习、基因测序数据分析、数据库构建及公共数据库挖掘等工作。在《New England》、《Plos One》和《BMCL》等国际期刊上发表了多篇学术论文。
【报名费用】
注册费:4200元/人。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
学习说明:
1、培训建有班级群,用于课上交流、课后答疑,群永不解散;
2、免费提供当期课程视频回看,供课后复习巩固;
3、免费赠送当期课程所用课件、软件、代码、案例资料等。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
老学员及其推荐学员参加均可额外优惠200元。
【付费方式】
手机银行或电子银行转账、银行汇款等
单位全称:北京市计算中心有限公司
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京自贸试验区永丰基地支行
(汇款信息备注:“智能计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)
注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。
【咨询请联系】
QQ号:3498448850
邮箱:bcc_peixun@163.com
张老师:18618295767(微信同号)
郭老师:18976866894
【注】开课前三天会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。
探索AI前沿:抗体药物设计全流程实训课
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